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リポジトリ中のディレクトリ $CVSROOT/CVSROOT に、 cvs を支援する多くのファイルが置かれます。 これらのファイルが無いと cvs の能力が制限されてしまいますが、 適切に設定すれば種々の操作を簡略化することができます。 これらを編集する方法は Intro administrative files 参照。
これらの内で最も重要なファイルは modules で、 リポジトリ内のモジュールを定義します。